奥本·海默万万不会想到，首批原子弹（间接）受难者是己方水手——“印第安纳波利斯”号重巡洋舰受命执行绝密任务，于1945年7月26日将原子弹部件运抵天宁岛：

卸下原子弹部件后，该船遵照指示前往菲律宾莱特岛与爱达荷号航母会合，为进攻日本本土做准备。7月30日夜，“印第安纳波利斯”号进入菲律宾海域，没有护航，未执行Z字规避航线，被潜伏在此的日本潜艇盯上。两枚威力巨大之九三酸素鱼雷将其炸为两截，仅12分钟便沉入海底，300人随船沉没，879人落水。

菲律宾海域生活着两百多种鲨鱼，攻击性较强的有白鳍鲨、虎鲨、牛鲨等。由于船只下沉过快，船员来不及放下足够的救生艇，落水后只能泡在水里，抓住救生筏边缘等待救援，其中很多人身上有伤，吸引大批鲨鱼前来围观。

起初鲨鱼只用身体轻触落水者，查看对方的反应，然后游走。就在人们松了一口气之时，鲨鱼返身杀回，在人群外围凫水的船员首先遭难，海水被鲜血染红，血腥味与人们挣扎拍水的动静使鲨鱼受到强烈刺激，攻击行为更猛烈也更大胆。

鲨鱼的袭击持续了四天，落水者同时还面临低温症与脱水的威胁，许多人精神错乱，松开双手魂归大海，最终只有316人获救，其中包括舰长查尔斯·麦克维。

军方以麦克维未能执行Z字规避航线为由将其送上军事法庭，是太平洋战争中唯一因沉船损失招致军法审判的船长。死者的家属也没有放过他，每年都给他寄贺卡，上面写着：“圣诞节快乐！如果我儿子还在，这个节会更快乐。”

在鲨口中幸存下来的麦克维最后没能抗住这份负罪感，以70岁高龄于1968年在自家后院自杀。

28年后，六年级学生亨特·斯科特的历史研究论文以“印第安纳波利斯号”为题，引发全国关注。继承了船名的“印第安纳波利斯”号核潜艇船长在事件幸存者的推动下，以攻方视角证明，即便麦克维走Z字航线，也无法逃脱日方I-58潜艇的攻击。况且麦克维当时接到的命令是，“在气象条件许可的前提下自行决定Z字航路”。

2001年7月，为海军指挥系统漏洞背了半个世纪黑锅的查尔斯·麦克维终得平反，服役纪录中所有指控被清除。2017年8月19日，微软创始人保罗·艾伦的科考船发现了沉于5500米深处的“印第安纳波利斯”号残骸，此时距这桩惨案已过去了72年。

幸存者中如今仅剩一位在世，96岁高龄的Harold Bray：

当年在广岛上空投放的“小男孩”原子弹上写有涂鸦，其中一条是：“来自印第安纳波利斯号的问候！”