微软为了对抗开源软件，先是声称开源软件侵犯自己数百项专利，接着又先后与Novell、Xandros、Linspire这三家Linux公司签署了专利保护协议，不针对他们的专利问题进行起诉。

不过，在微软继续扩大Linux阵地的时候，却遇到了阻力，并不是所有的Linux厂商都买他的账，最近，Mandriva的总裁Francois Bancilhon公开表示，他们不会与微软签署专利协议。与Mandriva持相同态度的还有Canonical和红帽。

微软去年11月和Novell开始合作，他们工作中重要的一点也是增加Windows和linux的协调互通性。但反对者例如红帽，他们表示不会给微软交“创新税”，Ubuntu创始人Mark Shuttleworth也在其博客中发表文章，表示不会和微软交易。

“Windows和linux之间的协调互通性是很重要的一点，任何能改进这一点的事情都是好的。”Mandriva总裁认为没有理由跟微软合作或者“屈服”，“但同时我们也坚信我们看到的，现在没有任何明显的证据表明开源软件有专利问题。”