微星的PCI-E 3.0主板本来只有Z68A-GD80 (G3)这么一款，不过发布的时候又增加了一款稍低端的Z68A-GD65 (G3)，都基于Intel Z68芯片组。除了支持PCI-E 3.0之外，这两款主板分别和已有的Z68A-GD80 (B3)、Z68A-GD65 (B3)一模一样。

具体是如何实现PCI-E 3.0的微星没有公开，但相信也是加装了第三方控制器。

Z68A-GD80 (G3)有三条PCI-E x16插槽，其中前两条支持PCI-E 3.0，第三条是PCI-E 2.0。带宽方面和华擎的完全相同，不过因为没有PCI-E桥接芯片，第三条插槽安装设备之后将导致两条PCI插槽、eSATA接口、第七个SATA接口、一个前置USB 3.0插针、背部IEEE1394a接口等等全部无法使用。另外两条PCI-E x1插槽也不能同时使用。