在操作系统上，Linux以381台、76.2％的占有率无可匹敌，微软的Windows Compute Cluster Server 2003则仅有6台，Mac OS X也占了2台。
就系统制造厂商而言，IBM和惠普的位置依然非常牢固，分别占有TOP500中的232台和166台，占46.6％和33.2％。IBM在2004年6月超越惠普，但上一次曾经输给对手，这次又赢了回来。
超级计算机数量厂商分布
超级计算机性能厂商分布
此外，TOP500的总性能从4.92 PFlop/s增至6.97 PFlop/s，入门成绩则从4.0 TFlop/s提高到了5.9 TFlop/s，而这一水准在六个月前可以排在第255位，由此可见超级计算机能力的发展之迅猛。
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