捆绑流氓软件获利
就像番茄花园在版本声明里面提及的，它只提供免费下载，并不出售盗版光盘，市面上见到的盗版光盘均是网友下载后自行刻录或盗版商批量生产的软件，并非洪磊他们出售的，从这个角度上看，番茄花园并未由此获利。
根据我国的法律，未经许可修改他人软件，如果没有因此获利，定罪较为困难，尽管洪磊没有通过出售光盘获利，但据了解，番茄花园中捆绑了广告插件，这可能是他获利的途径。
一些使用过番茄花园版XP的用户反映，他们在操作系统中发现了阿里巴巴的竞价、3721、一搜、多多QQ表情、CNNIC、播霸网络电视等流氓软件。洪磊所在的番茄花园团队后来澄清说，这些软件是第三方公司下载了番茄花园版XP后自己装上的，然后再提供给用户下载，或通过光盘传播。但一些从番茄花园网站下载美化版XP发现里面仍然有两款软件，一款为易趣网的插件，一款为雅虎助手。番茄花园论坛的一位管理员曾表示，这两款软件不是流氓软件，有安装提示，且可以卸载，不具备流氓软件的特征。
既便如此，番茄花园在后来的版本中捆绑了插件已是不争的事实。按照当时盛行的行业规则，批量的预装插件可以按照装机量获得广告收入。
近日的论坛报料指出，警察在“番茄花园的老大被抓后，查处其帐户有200多万元存款”，如果这一消息属实，这也许就是番茄花园的非法获利。
微软收网？
番茄花园作者被拒的消息已经让整个修改版XP圈子风声鹤唳。
据新浪科技调查了解，类似番茄花园的修改版XP还包括深度版、雨林木风版、电脑公司装机版、铂金花园版、萝卜家园版、极速工作室版、诺德尔版、永航技术版等，这其中的一些版本的网站在这几天开始无法访问，其论坛中的介绍如何破解微软正版验证的帖子也被删除，至于是同样在接受调查还是仅“关门避避风头”还不清楚。
有分析认为，番茄花园此次被调查与奥运期间严打盗版侵权不无关系。商务部及国家工商总局7月22日曾联合发出通知，要求各地在奥运期间，严厉打击“地摊、游商小贩销售假冒侵权商品行为”，以做好知识产权保护工作。
由于番茄花园涉及的是版权问题，其可能存在的侵权行为正是涉及微软公司，因此有人猜测，此次洪磊被拘留微软“功不可没”。微软中国公司尚未对此发表评论。
有网友认为，“番茄花园因为自身的一些特点在一些人群中受到欢迎，它为微软Window XP操作系统在中国的普及起到了很大的促进作用，微软赶在XP即将退市时‘动手’，其动机值得怀疑，这是卸磨杀驴的行为。”
也有一些网友表达了不同的看法，“中国加强知识产权保护的政策是不变的，如果有侵权行为，受到查处是理所当然的，即使微软在背后推动此事，那也是他的正当权益。”
国家知识产权总局副局长张勤在今年4月接受新浪科技独家专访时曾表示，相关部门现在已经意识到在知识产权保护领域，一些国际企业“放水养鱼，鱼大了后拉网收鱼”带来的危害，今后将加强对类似的行为进行规范。
